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ACAIC 2024下一代空間多組學(xué)檢測技術(shù)論壇通知
2024/10/28來源:中國儀器儀表學(xué)會分析儀器分會閱讀:369 次

空間多組學(xué)檢測技術(shù)不僅能保留組織的形態(tài)學(xué)信息,而且在高通量、高分辨率和多模態(tài)上取得了長足的進(jìn)步。但目前仍然缺少兼容性強(qiáng)、捕獲率高且原位組織綜合分析能力,也亟待產(chǎn)生新的數(shù)據(jù)融合分析算法。下一代空間多組學(xué)檢測技術(shù)圍繞將這些問題,面向臨床檢測,需要多學(xué)科交叉推進(jìn)預(yù)處理及檢測設(shè)備的創(chuàng)新發(fā)展。

 

會議時間:2024年11月16日14:00-18:00

會議地點(diǎn):深圳登喜路國際大酒店·國際廳1

組織機(jī)構(gòu):中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院

論壇主席:中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院副院長 孫飛研究員

論壇召集人:中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院 彭廣敦研究員

論壇主持人:中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康院 彭廣敦研究員、張驍研究員

專題論壇日程:

 

時長

會議內(nèi)容

14:00-14:10

中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院副院長孫飛研究員 致辭

14:10-14:30

報告人:楊朝勇教授 上海交通大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究院

報告題目:單細(xì)胞時空間組學(xué)測序儀器及應(yīng)用

14:30-14:50

報告人:黃巖誼教授 北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院

報告題目:亞細(xì)胞分辨率的原位空間轉(zhuǎn)錄本定量與定位分析

14:50-15:10

報告人:田魯亦研究員 廣州國家實(shí)驗(yàn)室

報告題目:Graph-based contrastive learning enables fast single-cell and spatial embedding

15:10-15:30

報告人:鄔建敏教授 浙江大學(xué)化學(xué)系

報告題目:印跡質(zhì)譜成像技術(shù)及其在臨床空間組學(xué)的應(yīng)用

15:30-15:50

報告人:孫飛研究員 中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院

報告題目:體電子顯微學(xué)和細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)圖譜

15:50-16:00

茶歇時間

16:00-16:20

報告人:曹罡教授 深圳理工大學(xué)

報告題目:單細(xì)胞多模態(tài)空間組學(xué):從分子生化到儀器開發(fā)

16:20-16:35

報告人:劉敏 青島百創(chuàng)智能制造技術(shù)有限公司副總裁

報告題目:大尺寸空間轉(zhuǎn)錄組芯片及其配套精準(zhǔn)細(xì)胞分割成像系統(tǒng)

16:35-16:55

報告人:唐愛輝教授 中國科技大學(xué)

報告題目:空間多組學(xué)成像技術(shù)和全自動分析平臺Metascope開發(fā)

16:55-17:10

報告人:趙福明 北京鎂伽科技有限公司市場總監(jiān)

報告題目:數(shù)據(jù)驅(qū)動的新一代實(shí)驗(yàn)室

17:10-17:30

報告人:彭廣敦研究員 中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院

報告題目:空間多組學(xué)技術(shù)開發(fā)與應(yīng)用

17:30-17:45

報告人:倪鳴 深圳華大智造科技股份有限公司高級副總裁

報告題目:從基因到細(xì)胞-多組學(xué)的時空探索

 

 

論壇主席

中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院副院長 孫飛研究員

 

孫飛,中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院,副院長(主持工作),研究員,杰青。歷任中國科學(xué)院生物物理研究所研究員、博士生導(dǎo)師,蛋白質(zhì)科學(xué)研究平臺生物成像中心主任、首席專家,廣州生物島實(shí)驗(yàn)室生物電子顯微鏡研發(fā)中心主任。開展以冷凍電子顯微術(shù)為主的結(jié)構(gòu)生物學(xué)和生物成像技術(shù)研究,在國內(nèi)率先完成了國際一流的生物成像中心設(shè)施建設(shè),其團(tuán)隊(duì)在生物電鏡前沿技術(shù)創(chuàng)新、裝備開發(fā)和科學(xué)應(yīng)用研究方面取得一系列重要成果,發(fā)表研究論文160余篇,被引7900多次,H-index 41,授權(quán)發(fā)明專利20余項(xiàng),研制超快冷凍電鏡、120kV場發(fā)射透射電鏡等高端科學(xué)儀器和關(guān)鍵核心部件多項(xiàng),為我國冷凍電鏡技術(shù)推廣、發(fā)展和創(chuàng)新,電鏡高端科學(xué)儀器裝備研發(fā)做出重要貢獻(xiàn)。

中國生物物理學(xué)會第十一屆理事會常務(wù)理事、中國電子顯微鏡學(xué)會第十一屆理事會常務(wù)理事、中國生物物理學(xué)會冷凍電子顯微學(xué)分會第二屆理事會副理事長、北京電鏡學(xué)會第七屆理事會副理事長、中國儀器儀表學(xué)會顯微儀器分會委員。Biophysics Reports副主編、《生物物理與生物化學(xué)進(jìn)展》副主編、INTERNATIONAL UNION OF CRYSTALLOGRAPHY(IUCrJ)的CryoEM編委。

 

報告人簡介及報告摘要

 

報告人:廈門大學(xué) 楊朝勇教授

報告題目:微流控單細(xì)胞時空組學(xué)分析系統(tǒng)

 

楊朝勇,國家杰出青年科學(xué)基金獲得者、廈門大學(xué)南強(qiáng)特聘教授、上海交通大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究院副院長、譜學(xué)分析與儀器教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任、中國化學(xué)會化學(xué)生物學(xué)學(xué)科委員會副主任、美國化學(xué)會Analytical Chemistry副主編。主持國家基金委重大項(xiàng)目課題、基金委重點(diǎn)項(xiàng)目、國家重大科研儀器研制項(xiàng)目、科技部重點(diǎn)專項(xiàng)課題、國家杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目等。在Chem. Rev.、Nat. Biotechnol.、Nat. Commun.、Sci. Adv.、PNAS、JACS等刊物發(fā)表論文300余篇,論文被引超過19000余次,H指數(shù)75。獲授權(quán)發(fā)明專利70余項(xiàng)。獲中美化學(xué)與化學(xué)生物學(xué)教授協(xié)會杰出教授獎、中國青年分析化學(xué)家獎、中國化學(xué)會-英國皇家化學(xué)會青年化學(xué)獎、廈門市科技進(jìn)步一等獎、福建省科技進(jìn)步一等獎、美國化學(xué)會測量科學(xué)進(jìn)展講座獎等榮譽(yù)。

報告摘要:報告人近年圍繞發(fā)展基于微流控的單細(xì)胞測序新方法,創(chuàng)制了系列國際先進(jìn)的自主產(chǎn)權(quán)的微流控單細(xì)胞時空組學(xué)分析系統(tǒng),包括1)單細(xì)胞自動化多組學(xué)分析系統(tǒng):其基于數(shù)字微流控芯片自動化液滴操控技術(shù),實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞高效分離與多組分分析。2)高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng):協(xié)同局部準(zhǔn)靜態(tài)流體力學(xué)和尺寸排阻原理,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞和編碼微球高效精準(zhǔn)“配對”和游離核酸移除,實(shí)現(xiàn)高通量細(xì)胞捕獲、高靈敏基因檢出和單細(xì)胞高保真分子解析。3)空間轉(zhuǎn)錄組測序系統(tǒng):首次將微流控界面化學(xué)調(diào)控與核酸空間編碼相結(jié)合,實(shí)現(xiàn)組織轉(zhuǎn)錄組測序成像,顯著提升了空間轉(zhuǎn)錄組測序的空間分辨率和檢測靈敏度。以上系統(tǒng)為癌癥、免疫、神經(jīng)和發(fā)育等領(lǐng)域研究提供分析平臺。

 

報告人:北京大學(xué) 黃巖誼教授

報告題目:亞細(xì)胞分辨率的原位空間轉(zhuǎn)錄本定量與定位分析

 

黃巖誼,北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院博雅特聘教授,北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心研究員,北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心研究員;兼任深圳灣實(shí)驗(yàn)室資深研究員;教育部長江學(xué)者特聘教授,國家杰出青年科學(xué)基金獲得者。主要從事微量核酸分析研究,集中工作在測序技術(shù)、單細(xì)胞分析和微流控技術(shù)等方向。

報告摘要空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)已經(jīng)徹底改變了我們對細(xì)胞類型和組織結(jié)構(gòu)的理解,為研究人員探索亞細(xì)胞水平的轉(zhuǎn)錄分布開辟了新的可能性。然而,現(xiàn)有的方法在分辨率、靈敏度或速度方面存在限制。為了克服這些挑戰(zhàn),我們研發(fā)了SPRINTseq(空間分辨和信號稀釋的下一代靶向測序)方法,這是一種創(chuàng)新的原位測序策略,結(jié)合了混合塊編碼和分子稀釋策略。我們的方法能夠?qū)崿F(xiàn)快速且靈敏的高分辨率數(shù)據(jù)采集,可以在不到兩天內(nèi)從四個小鼠腦冠狀切片的453,843個細(xì)胞中獲取超過1.42億個轉(zhuǎn)錄本。利用這種技術(shù),我們揭示了阿爾茨海默病的細(xì)胞和亞細(xì)胞分子結(jié)構(gòu),為異常細(xì)胞行為及其亞細(xì)胞mRNA分布提供了更加細(xì)致的數(shù)據(jù)。這種改進(jìn)的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)對于探索復(fù)雜的生物過程和疾病機(jī)制具有巨大的潛力。

 

報告人:廣州國家實(shí)驗(yàn)室 田魯亦研究員

報告題目:Graph-based contrastive learning enables fast single-cell and spatial embedding

 

田魯亦,廣州國家實(shí)驗(yàn)室研究員(PI),廣州醫(yī)科大學(xué)特聘教授,國家重大人才項(xiàng)目入選者(青年),墨爾本大學(xué)生物醫(yī)學(xué)專業(yè)博士,之后在美國博德研究所從事研究工作。課題組干濕結(jié)合,主要從事單細(xì)胞組學(xué),空間組學(xué)和納米孔測序的新設(shè)備和新技術(shù)研發(fā),以及相應(yīng)的數(shù)據(jù)分析流程和新算法開發(fā)。課題組用新組學(xué)技術(shù)研究免疫系統(tǒng)在時間和空間上的調(diào)控以及在呼吸疾病中的作用。生物學(xué)方面研究成果包括造血干細(xì)胞分化譜系追蹤,研究免疫系統(tǒng)癌癥耐藥性,建立新冠感染的免疫反應(yīng)多組學(xué)時間動態(tài)圖譜等。技術(shù)方面開發(fā)了單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組技術(shù)和對應(yīng)的數(shù)據(jù)分析流程,以及空間轉(zhuǎn)錄組3D拼接算法。以第一或通訊作者在Nature Methods(兩篇),Nature Immunology,Immunity,Nature Genetics,Nature Biotechnology,Blood,STTT,Genome Biology等在內(nèi)的專業(yè)雜志發(fā)表高水平論文,他引超過2000次、H-index為19。

報告摘要Single-cell and spatial omics has the potential to transform our understanding of tissue-specific functions by revealing the intricate cellular niches and interactions within tissues. However, the effective integration and characterization of cell niches across single-cell omics and spatial omics samples remain significant challenges, limiting the full utility of these technologies. Current methods lack the ability to efficiently co-embed cells from multiple tissue samples into a unified reference space, which is crucial for constructing comprehensive spatial atlases and understanding tissue heterogeneity.

Here, we present Garfield (Graph-based Contrastive Learning Enables Fast Single-Cell Embedding), a novel geometric deep-learning approach designed to address these challenges through interaction-aware cell embedding. Utilizing a graph contrastive learning framework, Garfield learns a shared embedding space for data generated from different technologies, facilitating the construction and querying of spatial reference atlases. Our results demonstrate that Garfield consistently outperforms existing state-of-the-art models in identifying spatial domains across multiple datasets. These findings highlight Garfield's potential to advance the field of spatial omics by providing a robust tool for integrating and interpreting complex spatial data across various tissue types and modalities.

 

報告人:浙江大學(xué) 鄔建敏教授

報告題目:印跡質(zhì)譜成像技術(shù)及其在臨床空間組學(xué)的應(yīng)用

 

鄔建敏,浙江大學(xué)化學(xué)系教授,博士生導(dǎo)師,浙江大學(xué)附屬邵逸夫醫(yī)院、浙江大學(xué)附屬兒童醫(yī)院兼聘教授,浙江省肝臟疾病多組學(xué)精準(zhǔn)診治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任,杭州市錢江特聘教授。主持6項(xiàng)國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目及多項(xiàng)省部級重點(diǎn)項(xiàng)目。已在國際著名期刊發(fā)表論文近百篇,獲得四十余項(xiàng)中國發(fā)明專利及國際專利授權(quán)。主要研究領(lǐng)域包括:微納質(zhì)譜芯片在高通量代謝與肽組學(xué)分析、液體活檢與組織活檢、質(zhì)譜組織成像中的應(yīng)用;生物傳感及人體呼出氣分析系統(tǒng)。通過產(chǎn)學(xué)研合作建立了基于高通量質(zhì)譜平臺的體外診斷系統(tǒng),獲得了浙江省高端醫(yī)療裝備首臺套重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目,并帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)獲得全球首臺用于人體血液蛋白與多肽組檢測的臨床質(zhì)譜醫(yī)療器械注冊證。

報告摘要本報告將介紹一種基于垂直硅納米線(SiNWs)陣列的印跡質(zhì)譜成像技術(shù),該技術(shù)在非小細(xì)胞肺癌、腎癌、原發(fā)性肝細(xì)胞肝癌(HCC)、肝內(nèi)膽管癌(ICC)等臨床組織樣本的空間代謝組學(xué)中得到了成功的應(yīng)用。結(jié)合組織學(xué)病理分析,篩選出了腫瘤組織與邊緣正常組織間的關(guān)鍵差異代謝物?;谌斯ど窠?jīng)網(wǎng)絡(luò)等機(jī)器學(xué)習(xí)模型,建立了臨床組織良惡性判別、腫瘤邊緣、代謝亞型分型等判別方法。通過轉(zhuǎn)錄組與代謝組等多組學(xué)聯(lián)合分析,明確了與HCC及ICC相關(guān)的關(guān)鍵擾動代謝通路、基因及最終產(chǎn)物,發(fā)現(xiàn)了嘧啶代謝在HCC和ICC中存在顯著差異。這些發(fā)現(xiàn)揭示了空間代謝組學(xué)分析在分子病理診斷中的價值,為腫瘤異質(zhì)性和癌癥藥物靶點(diǎn)的研究了提供新思路。

 

 

報告人:深圳理工大學(xué) 曹罡教授

報告題目:單細(xì)胞多模態(tài)空間組學(xué):從分子生化到儀器開發(fā)

 

 曹罡,荷蘭NCMLS中心博士,冷泉港實(shí)驗(yàn)室博士后,萬人計劃領(lǐng)軍人才,深圳理工大學(xué)教授,博士生導(dǎo)師。長期從事新興生物技術(shù)開發(fā),尤其是單細(xì)胞空間組學(xué)(原位測序),單細(xì)胞三維基因組學(xué)新技術(shù)的開發(fā),F(xiàn)ISH流式技術(shù)開發(fā)及其在神經(jīng)免疫與感染交叉學(xué)科和精準(zhǔn)診斷中的運(yùn)用。主持、參與十三五/十四五重大研發(fā)計劃,基金委重點(diǎn)項(xiàng)目、聯(lián)合基金重點(diǎn)項(xiàng)目,面上項(xiàng)目多項(xiàng)。獲國家教學(xué)二等獎、中華醫(yī)學(xué)科技二等獎,國家精品慕課課程,國家一流本科生課程等。近年來以聯(lián)系作者在Nature Genetics, Nature Biomedical Engineering, Neuron, Nature Communications, Science Advances, Nucleic Acids Res, Genome Biology等一流刊物發(fā)表論文多篇。獲批專利12項(xiàng),并實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化、獲批醫(yī)療器械證多項(xiàng)。相關(guān)研究被頂級雜志和媒體廣泛關(guān)注。Nature Genetics, Nature Reviews Neuroscience , Neuron, JACC等國際頂級雜志發(fā)表專題評述。同時也得到了“國際科技創(chuàng)新中心”、“科學(xué)網(wǎng)”等廣泛關(guān)注和報道及科技導(dǎo)報年度熱點(diǎn)研究評論。

報告摘要生物大分子(蛋白質(zhì)、DNA、RNA等)在組織、細(xì)胞內(nèi)的精確定位對生命體維持正常功能扮演著重要角色。在單細(xì)胞水平高通量的檢測生物大分子的原位空間組學(xué)新技術(shù)對理解生命的重要生理功能及疾病的發(fā)生發(fā)展有著重要意義。近年來,我們開發(fā)了一系列的單細(xì)胞生物大分子原位組學(xué)檢測新技術(shù),包括(單細(xì)胞)三維基因組學(xué)、單細(xì)胞原位測序技術(shù)(MiP-Seq)、新型中低通量單分子FISH技術(shù)、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)及其高通量空間定位技術(shù)和結(jié)合神經(jīng)環(huán)路的單細(xì)胞測序技術(shù)。同時,我們也將這些技術(shù)運(yùn)用到神經(jīng)免疫學(xué)與病原感染、腫瘤等疾病的發(fā)生發(fā)展及其檢測研究中。

 

報告人:北京百邁客生物科技有限公司 劉敏副總裁

報告題目:大尺寸空間轉(zhuǎn)錄組芯片及其配套精準(zhǔn)細(xì)胞分割成像系統(tǒng)

 

劉敏,男,現(xiàn)任青島百創(chuàng)智能智造有限公司副總裁。畢業(yè)于西北農(nóng)林科技大學(xué)生物信息學(xué)專業(yè)。自2012年加入百邁客生物以來,憑借對生物信息學(xué)的深刻理解和不懈追求,帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)在時空組學(xué)領(lǐng)域取得了卓越的成就。初入百邁客生物,劉敏便投身于生物信息學(xué)研發(fā)工作,憑借扎實(shí)的專業(yè)基礎(chǔ)和敏銳的洞察力迅速嶄露頭角。他不僅精通生物信息學(xué)的核心技術(shù),更懂得如何將這些技術(shù)應(yīng)用于實(shí)際產(chǎn)品中,有效推動公司的業(yè)務(wù)發(fā)展。在時空組學(xué)方向,劉敏帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)了行業(yè)領(lǐng)先的基于微孔微珠的亞細(xì)胞級分辨率百創(chuàng)S系列空間轉(zhuǎn)錄組芯片、百創(chuàng)精準(zhǔn)時空成像系統(tǒng)BH1000以及極速單細(xì)胞微液滴生成平臺百創(chuàng)DG1000。這些產(chǎn)品不僅填補(bǔ)了市場空白,更為科研工作者提供了強(qiáng)大的支持,推動了生物科技的進(jìn)步。

報告摘要近年來,空間組學(xué)成為極為重要的科研熱點(diǎn)。然而,目前大部分空間芯片主要集中在小面積芯片領(lǐng)域。在此背景下,百創(chuàng)智造在原有百創(chuàng) S 級芯片(尺寸分別為 6.8mm×6.8mm、11mm×11mm 與 15mm×20mm)的基礎(chǔ)上,成功開發(fā)出了尺寸為 50mm×60mm 的大尺寸空間轉(zhuǎn)錄組芯片。同時,為解決大面積組織的快速高清成像問題,百創(chuàng)智造還研發(fā)了配套的顯微成像系統(tǒng),可實(shí)現(xiàn)快速、高清成像。此外,通過配合專門開發(fā)的圖像校準(zhǔn)算法與細(xì)胞分割算法,能夠精準(zhǔn)進(jìn)行細(xì)胞分割,從而構(gòu)建出大面積細(xì)胞級別的空間轉(zhuǎn)錄組圖譜,為大尺寸空間組學(xué)研究領(lǐng)域的科研工作者增添了一把利器。本報告將以百創(chuàng) S 系統(tǒng)空間轉(zhuǎn)錄組芯片的設(shè)計與實(shí)際應(yīng)用表現(xiàn)為切入點(diǎn),對大尺寸空間轉(zhuǎn)錄組芯片及其配套的精準(zhǔn)細(xì)胞分割成像系統(tǒng)進(jìn)行詳細(xì)介紹。

 

 

報告人:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 唐愛輝教授

報告題目:空間多組學(xué)成像技術(shù)和全自動分析平臺Metascope開發(fā)

 

唐愛輝中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)與醫(yī)學(xué)部、微尺度國家科學(xué)中心教授、博導(dǎo),合肥綜合性國家科學(xué)中心人工智能研究院研究員,國家創(chuàng)新人才青年項(xiàng)目獲得者。長期致力于單分子顯微成像技術(shù)的開發(fā)和在神經(jīng)生物學(xué)中的應(yīng)用,利用單分子超分辨成像技術(shù)對神經(jīng)突觸的結(jié)構(gòu)和動態(tài)進(jìn)行了系統(tǒng)解析,取得包括突觸納米柱在內(nèi)的多項(xiàng)重要發(fā)現(xiàn)。近年來開發(fā)了基于成像的空間轉(zhuǎn)錄組和翻譯組技術(shù),并研制了全自動的空間多組學(xué)成像和分析平臺Metascope。以通訊作者在包括Nature、Nature Methods、Science Advances在內(nèi)的著名期刊上發(fā)表論文多篇。    

報告摘要:基于熒光成像的空間組學(xué)技術(shù)發(fā)展迅速,但其復(fù)雜的成像流程和圖像分析在工程和算法方面嚴(yán)重制約了技術(shù)的推廣與應(yīng)用。我們基于原創(chuàng)的BASSFISH空間轉(zhuǎn)錄組成像技術(shù),開發(fā)了一套通用全自動空間組學(xué)成像設(shè)備Metascope,并整合了基于AI的圖像分析和統(tǒng)計算法,推出了一款高自動化的空間組學(xué)成像數(shù)據(jù)分析軟件,從而建立了一個用戶友好的成像與分析平臺。

 

報告人:中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院 彭廣敦研究員

報告題目:空間多組學(xué)技術(shù)開發(fā)與應(yīng)用

 

彭廣敦,中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員,博士生導(dǎo)師,譜系技術(shù)與裝備研究中心執(zhí)行副主任,國家人類細(xì)胞譜系大科學(xué)設(shè)施副總工藝師,國家重點(diǎn)高層次人才,廣東省杰青。研究工作聚焦細(xì)胞譜系的時空動態(tài)解析及再現(xiàn),重點(diǎn)關(guān)注三維在體空間組學(xué)、空間譜系示蹤以及影像、表觀、轉(zhuǎn)錄組學(xué)在單細(xì)胞、空間以及功能干預(yù)層面的整合,相關(guān)工作以通訊作者發(fā)表在Nature,Nature Methods, Nature Genetics,Nature Communications, Ann Rheum Dis, Developmental Cell等國際頂級期刊,研究成果獲“中國生命科學(xué)十大進(jìn)展”、“中國生物信息學(xué)十大進(jìn)展”。

報告摘要“空間組學(xué)作為一個快速發(fā)展的領(lǐng)域,旨在彌補(bǔ)這一空白,通過解析細(xì)胞在其天然組織中的自然狀態(tài),使研究人員能夠識別位置定義的細(xì)胞類型,并理解塑造組織結(jié)構(gòu)和功能的復(fù)雜通訊網(wǎng)絡(luò)。將空間多組學(xué)和單細(xì)胞分析技術(shù)整合將進(jìn)一步能揭示了基因與其功能輸出之間的機(jī)制聯(lián)系。我將介紹空間轉(zhuǎn)錄組以及空間多組學(xué)技術(shù)的開發(fā)以及在發(fā)育與損傷中的應(yīng)用,這些組合技術(shù)如何通過可視化細(xì)胞類型、基因表達(dá)模式和信號級聯(lián)在胚胎發(fā)育與疾病的關(guān)鍵階段產(chǎn)生動態(tài)變化,從而以揭示支配組織編排、細(xì)胞命運(yùn)決定和器官發(fā)生的基本機(jī)制,助力于基本生命活動的理解?!?/span>

 

報告人:深圳華大智造科技股份有限公司 倪鳴高級副總裁

報告摘要:從基因到細(xì)胞-多組學(xué)的時空探索

 

倪鳴,北京大學(xué)物理學(xué)博士,法國國立衛(wèi)生研究院(INSERM)博士后,深圳市海外高層次人才,正高級工程師,現(xiàn)任華大智造高級副總裁,兼任TC526全國實(shí)驗(yàn)室儀器及設(shè)備標(biāo)準(zhǔn)化委員會委員。主要負(fù)責(zé)基因測序儀、自動化設(shè)備、前沿技術(shù)等系列關(guān)鍵技術(shù)的研發(fā),研究領(lǐng)域包括基因測序技術(shù)、生物傳感器、微流控技術(shù)、光學(xué)系統(tǒng)、系統(tǒng)生物學(xué)、合成生物學(xué)等交叉學(xué)科的前沿?zé)狳c(diǎn)領(lǐng)域。從事科研工作以來,作為項(xiàng)目負(fù)責(zé)人承擔(dān)并參與多個國家及省市級重大科研項(xiàng)目,在Plos Genetics, CELL, Nature Machine Intelligence等雜志發(fā)表論文10余篇,獲授權(quán)發(fā)明專利53項(xiàng)。曾獲中國專利優(yōu)秀獎、湖北省科技進(jìn)步二等獎,并獲評2019-2021年度青島西海岸新區(qū)勞動先模人物。

報告摘要20世紀(jì),DNA測序技術(shù)讓科學(xué)家第一次解析了生命大分子——DNA。測序技術(shù)出現(xiàn)后,我們可以對基因組序列進(jìn)行精準(zhǔn)解析,看到細(xì)胞內(nèi)部的生命大分子。單細(xì)胞多組學(xué)、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分別是Nature Methods在2019年和2020年的年度技術(shù)。如今,我們通過自主知識產(chǎn)權(quán)的分析工具,利用基因組學(xué)、細(xì)胞組學(xué)、時空組學(xué)等多組學(xué)技術(shù)開展研究,可以精確了解每個細(xì)胞內(nèi)的分子表達(dá),還能定位該細(xì)胞的空間位置,實(shí)現(xiàn)生命在時間和空間維度上細(xì)胞‘地圖’的全面繪制,在細(xì)胞甚至亞細(xì)胞分辨率下,觀察到正常狀態(tài)和疾病狀態(tài)下分子和細(xì)胞的分布及細(xì)胞之間的互作情況,真正實(shí)現(xiàn)從高精度結(jié)構(gòu)理解人類的發(fā)育、衰老和重要疾病的發(fā)生發(fā)展機(jī)制,不斷推動群體遺傳、精準(zhǔn)健康、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、發(fā)育與進(jìn)化等領(lǐng)域的生命科學(xué)研究。

 

關(guān)于ACAIC 2024

第九屆中國分析儀器學(xué)術(shù)大會(ACAIC 2024)將于2024年11月14-16日在廣東省深圳市召開。會議主題為“下一代分析儀器”,本次會議將研究和探討未來幾年分析儀器發(fā)展方向及布局建議,集中宣傳最新分析儀器及其關(guān)鍵部件高水平研發(fā)成果,進(jìn)一步提升用戶對國產(chǎn)儀器和國產(chǎn)關(guān)鍵部件的信心。 

 

主辦單位中國儀器儀表學(xué)會分析儀器分會

承辦單位中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院

專題論壇:

1.分析儀器重大研發(fā)成果進(jìn)展交流及展望論壇

2.生命科學(xué)創(chuàng)新與下一代分析儀器論壇

3.下一代質(zhì)譜技術(shù)的創(chuàng)新與突破論壇

4.光譜儀及核心元器件技術(shù)創(chuàng)新論壇

5.下一代熱分析與量熱儀器創(chuàng)新與應(yīng)用論壇

6.智能生物傳感技術(shù)創(chuàng)新論壇

7.下一代空間多組學(xué)檢測技術(shù)論壇

8.半導(dǎo)體材料/器件高質(zhì)量發(fā)展與下一代分析儀器論壇

9.下一代材料結(jié)構(gòu)與界面分析技術(shù)論壇

10.高質(zhì)量儀器共享和國產(chǎn)儀器推廣應(yīng)用論壇

報名參會:

 

參會報名注冊及贊助:

楊老師 18610289871(微信同號);ygx@fxxh.org.cn

 

詳細(xì)信息請見:第九屆中國分析儀器學(xué)術(shù)大會(ACAIC 2024) 第輪通知

 

組織機(jī)構(gòu)簡介:

中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院(簡稱“廣州健康院”)面向人類健康與“健康中國”戰(zhàn)略,聚焦生命健康領(lǐng)域前沿重大科學(xué)問題和重要疾病機(jī)理,以建成國際一流的生物醫(yī)藥與健康領(lǐng)域新型研發(fā)機(jī)構(gòu)和創(chuàng)新人才培養(yǎng)高地為目標(biāo),滿足國家戰(zhàn)略需求和區(qū)域經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展,促進(jìn)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展,發(fā)揮國家戰(zhàn)略科技力量的核心作用。廣州健康院承建國家人類細(xì)胞譜系大科學(xué)設(shè)施,圍繞國家生命健康發(fā)展戰(zhàn)略,以大中型自研科學(xué)裝置為基礎(chǔ),以先進(jìn)成像、人工智能等創(chuàng)新技術(shù)集成為核心,以數(shù)字生理人和功能細(xì)胞譜系資源庫為重大應(yīng)用出口,建設(shè)高度自動化、智能化、標(biāo)準(zhǔn)化和集成化的國際一流細(xì)胞譜系綜合性研究設(shè)施,促進(jìn)新一代醫(yī)學(xué)技術(shù)的變革。


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