嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒 2 (SARS-CoV-2) 的演變突出了對(duì)能夠區(qū)分新出現(xiàn)的病毒變體的多功能診斷分析的需求。然而,目前,允許我們快速解決 SARS-CoV-2 突變以識(shí)別其變體的工具并不容易獲得。用于 SARS-CoV-2 變體的可擴(kuò)展篩選工具理想情況下應(yīng) (i) 允許檢測(cè)病毒 RNA 中的單核苷酸突變,(ii) 提供較短的樣本到結(jié)果的時(shí)間,以及 (iii) 提供多路復(fù)用能力以識(shí)別多種變體。
鑒于此,清華大學(xué)李景虹院士聯(lián)合四川大學(xué)李為民教授、鄧銳杰副教授等人報(bào)告了一種廉價(jià)(每次測(cè)試約 0.30 美元(約2塊錢人民幣))檢測(cè)的開發(fā)和性能基準(zhǔn)測(cè)試,用于快速(30min 內(nèi)的樣本到答案時(shí)間)比色檢測(cè)SARS-CoV-2 變體。
研究人員將其整合到可折疊紙條中的分析利用了核酸鏈置換反應(yīng)、與單堿基對(duì)錯(cuò)配相關(guān)的熱力學(xué)能量損失和金屬離子控制的尿素酶切來放大對(duì)病毒RNA的識(shí)別,以便通過智能手機(jī)比色讀出pH值的變化。
對(duì)于50份咽拭子樣本,該測(cè)定同時(shí)檢測(cè)到 SARS-CoV-2 的存在以及SARS-CoV-2變體α、β和γ的特異性突變,與實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)和RNA測(cè)序完全一致。用于檢測(cè)病毒及其變體的可定制且廉價(jià)的紙質(zhì)化驗(yàn)可能有助于病毒監(jiān)測(cè)。
研究人員還開發(fā)了一個(gè)智能手機(jī)應(yīng)用程序(應(yīng)用程序)來指導(dǎo)診斷,并可視化和記錄臨床和冷鏈?zhǔn)称窐悠返臏y(cè)試結(jié)果。